Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3488M0QW81 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3488M0QW81 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3488M0QW81 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3488M0QW81 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3488M0QW81 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3488M0QW81 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3488M0QW81 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3488M0QW81 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3488M0QW81 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3488M0QW81 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3488M0QW81 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3488M0QW81 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3488M0QW81 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3488M0QW81 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3488M0QW81 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3488M0QW81 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3488M0QW81 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3488M0QW81 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3488M0QW81 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3488M0QW81 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3488M0QW81 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3488M0QW81 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3488M0QW81 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3488M0QW81 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3488M0QW81 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3488M0QW81 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3488M0QW81 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3488M0QW81 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3488M0QW81 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3488M0QW81 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3488M0QW81 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3488M0QW81 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3488M0QW81 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3488M0QW81 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3488M0QW81 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3488M0QW81 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3488M0QW81 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm3488M0QW81 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm3488M0QW81 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3488M0QW81 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm3488M0QW81 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3488M0QW81 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3488M0QW81 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3488M0QW81 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3488M0QW81 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3488M0QW81 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3488M0QW81 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3488M0QW81 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3488M0QW81 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3488M0QW81 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3488M0QW81 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3488M0QW81 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3488M0QW81 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3488M0QW81 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3488M0QW81 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3488M0QW81 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3488M0QW81 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3488M0QW81 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3488M0QW81 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3488M0QW81 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3488M0QW81 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3488M0QW81 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3488M0QW81 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3488M0QW81 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3488M0QW81 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3488M0QW81 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3488M0QW81 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm3488M0QW81 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms