Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3542K7N6U2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3542K7N6U2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3542K7N6U2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm3542K7N6U2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3542K7N6U2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3542K7N6U2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3542K7N6U2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm3542K7N6U2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3542K7N6U2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm3542K7N6U2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3542K7N6U2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3542K7N6U2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3542K7N6U2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3542K7N6U2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm3542K7N6U2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3542K7N6U2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3542K7N6U2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3542K7N6U2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm3542K7N6U2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3542K7N6U2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm3542K7N6U2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm3542K7N6U2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3542K7N6U2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm3542K7N6U2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3542K7N6U2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3542K7N6U2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3542K7N6U2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3542K7N6U2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3542K7N6U2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3542K7N6U2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3542K7N6U2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3542K7N6U2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3542K7N6U2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3542K7N6U2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3542K7N6U2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3542K7N6U2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3542K7N6U2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3542K7N6U2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3542K7N6U2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3542K7N6U2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3542K7N6U2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3542K7N6U2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3542K7N6U2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3542K7N6U2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3542K7N6U2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3542K7N6U2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3542K7N6U2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3542K7N6U2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3542K7N6U2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3542K7N6U2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3542K7N6U2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3542K7N6U2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3542K7N6U2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3542K7N6U2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3542K7N6U2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3542K7N6U2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3542K7N6U2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3542K7N6U2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3542K7N6U2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3542K7N6U2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3542K7N6U2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3542K7N6U2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3542K7N6U2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm3542K7N6U2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3542K7N6U2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3542K7N6U2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3542K7N6U2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3542K7N6U2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3542K7N6U2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm3542K7N6U2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm3542K7N6U2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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