Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3415J3QMS8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3415J3QMS8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm3415J3QMS8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm3415J3QMS8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm3415J3QMS8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm3415J3QMS8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm3415J3QMS8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm3415J3QMS8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm3415J3QMS8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm3415J3QMS8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm3415J3QMS8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm3415J3QMS8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm3415J3QMS8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm3415J3QMS8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3415J3QMS8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3415J3QMS8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3415J3QMS8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3415J3QMS8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3415J3QMS8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3415J3QMS8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm3415J3QMS8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3415J3QMS8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3415J3QMS8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3415J3QMS8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3415J3QMS8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3415J3QMS8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm3415J3QMS8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3415J3QMS8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3415J3QMS8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm3415J3QMS8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3415J3QMS8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3415J3QMS8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3415J3QMS8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm3415J3QMS8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3415J3QMS8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3415J3QMS8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm3415J3QMS8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
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