Protein–RNA interactions for Protein: J3QMM8

Gm7971, Predicted gene 16429, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7971J3QMM8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm7971J3QMM8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm7971J3QMM8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm7971J3QMM8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm7971J3QMM8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm7971J3QMM8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm7971J3QMM8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm7971J3QMM8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm7971J3QMM8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm7971J3QMM8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm7971J3QMM8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm7971J3QMM8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm7971J3QMM8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm7971J3QMM8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm7971J3QMM8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm7971J3QMM8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm7971J3QMM8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm7971J3QMM8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm7971J3QMM8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm7971J3QMM8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm7971J3QMM8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm7971J3QMM8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm7971J3QMM8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm7971J3QMM8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms