Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms