Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem200cJ3QK46 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem200cJ3QK46 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tmem200cJ3QK46 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmem200cJ3QK46 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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