Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pot1bH7BX60 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pot1bH7BX60 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pot1bH7BX60 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pot1bH7BX60 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pot1bH7BX60 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pot1bH7BX60 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pot1bH7BX60 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pot1bH7BX60 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pot1bH7BX60 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pot1bH7BX60 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pot1bH7BX60 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pot1bH7BX60 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pot1bH7BX60 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pot1bH7BX60 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pot1bH7BX60 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pot1bH7BX60 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pot1bH7BX60 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pot1bH7BX60 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pot1bH7BX60 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pot1bH7BX60 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pot1bH7BX60 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pot1bH7BX60 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pot1bH7BX60 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pot1bH7BX60 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pot1bH7BX60 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pot1bH7BX60 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pot1bH7BX60 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pot1bH7BX60 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pot1bH7BX60 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pot1bH7BX60 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pot1bH7BX60 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pot1bH7BX60 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pot1bH7BX60 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pot1bH7BX60 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pot1bH7BX60 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pot1bH7BX60 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pot1bH7BX60 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pot1bH7BX60 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pot1bH7BX60 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pot1bH7BX60 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pot1bH7BX60 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pot1bH7BX60 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pot1bH7BX60 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pot1bH7BX60 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pot1bH7BX60 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pot1bH7BX60 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pot1bH7BX60 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pot1bH7BX60 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pot1bH7BX60 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pot1bH7BX60 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pot1bH7BX60 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pot1bH7BX60 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pot1bH7BX60 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pot1bH7BX60 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pot1bH7BX60 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pot1bH7BX60 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pot1bH7BX60 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pot1bH7BX60 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pot1bH7BX60 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pot1bH7BX60 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pot1bH7BX60 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pot1bH7BX60 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pot1bH7BX60 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pot1bH7BX60 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pot1bH7BX60 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pot1bH7BX60 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pot1bH7BX60 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pot1bH7BX60 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pot1bH7BX60 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pot1bH7BX60 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pot1bH7BX60 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pot1bH7BX60 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pot1bH7BX60 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pot1bH7BX60 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pot1bH7BX60 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pot1bH7BX60 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pot1bH7BX60 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pot1bH7BX60 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pot1bH7BX60 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms