Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Colca2F8VPY8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Colca2F8VPY8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colca2F8VPY8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colca2F8VPY8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colca2F8VPY8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colca2F8VPY8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Colca2F8VPY8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Colca2F8VPY8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Colca2F8VPY8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Colca2F8VPY8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colca2F8VPY8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colca2F8VPY8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Colca2F8VPY8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Colca2F8VPY8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Colca2F8VPY8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Colca2F8VPY8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Colca2F8VPY8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Colca2F8VPY8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Colca2F8VPY8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Colca2F8VPY8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Colca2F8VPY8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Colca2F8VPY8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Colca2F8VPY8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Colca2F8VPY8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Colca2F8VPY8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Colca2F8VPY8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Colca2F8VPY8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Colca2F8VPY8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Colca2F8VPY8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Colca2F8VPY8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Colca2F8VPY8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Colca2F8VPY8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Colca2F8VPY8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Colca2F8VPY8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Colca2F8VPY8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Colca2F8VPY8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Colca2F8VPY8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Colca2F8VPY8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Colca2F8VPY8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Colca2F8VPY8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Colca2F8VPY8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Colca2F8VPY8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Colca2F8VPY8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Colca2F8VPY8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Colca2F8VPY8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Colca2F8VPY8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Colca2F8VPY8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Colca2F8VPY8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Colca2F8VPY8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Colca2F8VPY8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Colca2F8VPY8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Colca2F8VPY8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Colca2F8VPY8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Colca2F8VPY8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Colca2F8VPY8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Colca2F8VPY8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Colca2F8VPY8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Colca2F8VPY8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Colca2F8VPY8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Colca2F8VPY8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Colca2F8VPY8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Colca2F8VPY8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Colca2F8VPY8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Colca2F8VPY8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Colca2F8VPY8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Colca2F8VPY8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Colca2F8VPY8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Colca2F8VPY8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Colca2F8VPY8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Colca2F8VPY8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Colca2F8VPY8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Colca2F8VPY8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Colca2F8VPY8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Colca2F8VPY8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Colca2F8VPY8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Colca2F8VPY8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Colca2F8VPY8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Colca2F8VPY8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Colca2F8VPY8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Colca2F8VPY8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Colca2F8VPY8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Colca2F8VPY8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Colca2F8VPY8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Colca2F8VPY8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms