Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ttc37F8VPK0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ttc37F8VPK0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ttc37F8VPK0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ttc37F8VPK0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ttc37F8VPK0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ttc37F8VPK0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ttc37F8VPK0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ttc37F8VPK0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ttc37F8VPK0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ttc37F8VPK0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Ttc37F8VPK0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ttc37F8VPK0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ttc37F8VPK0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ttc37F8VPK0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ttc37F8VPK0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ttc37F8VPK0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ttc37F8VPK0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ttc37F8VPK0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ttc37F8VPK0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Ttc37F8VPK0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ttc37F8VPK0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ttc37F8VPK0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ttc37F8VPK0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ttc37F8VPK0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ttc37F8VPK0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Ttc37F8VPK0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ttc37F8VPK0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ttc37F8VPK0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Ttc37F8VPK0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ttc37F8VPK0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ttc37F8VPK0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ttc37F8VPK0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ttc37F8VPK0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ttc37F8VPK0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ttc37F8VPK0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ttc37F8VPK0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ttc37F8VPK0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ttc37F8VPK0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ttc37F8VPK0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Ttc37F8VPK0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ttc37F8VPK0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ttc37F8VPK0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ttc37F8VPK0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ttc37F8VPK0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ttc37F8VPK0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ttc37F8VPK0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ttc37F8VPK0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Ttc37F8VPK0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ttc37F8VPK0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ttc37F8VPK0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ttc37F8VPK0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ttc37F8VPK0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ttc37F8VPK0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ttc37F8VPK0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ttc37F8VPK0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ttc37F8VPK0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ttc37F8VPK0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ttc37F8VPK0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ttc37F8VPK0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ttc37F8VPK0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ttc37F8VPK0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ttc37F8VPK0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ttc37F8VPK0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ttc37F8VPK0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ttc37F8VPK0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ttc37F8VPK0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ttc37F8VPK0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ttc37F8VPK0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ttc37F8VPK0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ttc37F8VPK0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ttc37F8VPK0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Ttc37F8VPK0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ttc37F8VPK0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ttc37F8VPK0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ttc37F8VPK0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ttc37F8VPK0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ttc37F8VPK0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ttc37F8VPK0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ttc37F8VPK0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ttc37F8VPK0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ttc37F8VPK0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ttc37F8VPK0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ttc37F8VPK0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ttc37F8VPK0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Ttc37F8VPK0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ttc37F8VPK0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ttc37F8VPK0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ttc37F8VPK0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ttc37F8VPK0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ttc37F8VPK0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ttc37F8VPK0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ttc37F8VPK0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ttc37F8VPK0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ttc37F8VPK0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ttc37F8VPK0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Ttc37F8VPK0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ttc37F8VPK0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Ttc37F8VPK0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ttc37F8VPK0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms