Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm28048F7BCN0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm28048F7BCN0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm28048F7BCN0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm28048F7BCN0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm28048F7BCN0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm28048F7BCN0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm28048F7BCN0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm28048F7BCN0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm28048F7BCN0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm28048F7BCN0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms