Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Igkv1-99F6XWB2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Igkv1-99F6XWB2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Igkv1-99F6XWB2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Igkv1-99F6XWB2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Igkv1-99F6XWB2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Igkv1-99F6XWB2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Igkv1-99F6XWB2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Igkv1-99F6XWB2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Igkv1-99F6XWB2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Igkv1-99F6XWB2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Igkv1-99F6XWB2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Igkv1-99F6XWB2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Igkv1-99F6XWB2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Igkv1-99F6XWB2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Igkv1-99F6XWB2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Igkv1-99F6XWB2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Igkv1-99F6XWB2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Igkv1-99F6XWB2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Igkv1-99F6XWB2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-99F6XWB2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-99F6XWB2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-99F6XWB2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-99F6XWB2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-99F6XWB2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-99F6XWB2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igkv1-99F6XWB2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms