Protein–RNA interactions for Protein: F6VLK5

Gm10722, Predicted gene 10722, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10722F6VLK5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm10722F6VLK5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm10722F6VLK5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm10722F6VLK5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm10722F6VLK5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm10722F6VLK5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm10722F6VLK5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm10722F6VLK5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm10722F6VLK5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm10722F6VLK5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm10722F6VLK5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm10722F6VLK5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm10722F6VLK5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm10722F6VLK5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm10722F6VLK5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm10722F6VLK5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm10722F6VLK5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm10722F6VLK5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm10722F6VLK5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm10722F6VLK5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm10722F6VLK5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm10722F6VLK5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm10722F6VLK5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm10722F6VLK5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm10722F6VLK5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm10722F6VLK5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm10722F6VLK5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm10722F6VLK5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm10722F6VLK5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm10722F6VLK5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm10722F6VLK5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm10722F6VLK5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm10722F6VLK5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm10722F6VLK5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm10722F6VLK5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm10722F6VLK5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm10722F6VLK5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm10722F6VLK5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm10722F6VLK5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm10722F6VLK5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm10722F6VLK5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm10722F6VLK5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm10722F6VLK5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm10722F6VLK5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm10722F6VLK5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm10722F6VLK5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm10722F6VLK5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm10722F6VLK5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm10722F6VLK5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm10722F6VLK5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm10722F6VLK5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm10722F6VLK5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm10722F6VLK5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm10722F6VLK5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm10722F6VLK5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm10722F6VLK5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm10722F6VLK5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm10722F6VLK5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm10722F6VLK5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm10722F6VLK5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm10722F6VLK5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm10722F6VLK5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm10722F6VLK5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm10722F6VLK5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm10722F6VLK5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm10722F6VLK5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm10722F6VLK5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm10722F6VLK5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm10722F6VLK5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm10722F6VLK5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm10722F6VLK5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms