Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5861F6VCN9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5861F6VCN9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5861F6VCN9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm5861F6VCN9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5861F6VCN9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5861F6VCN9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5861F6VCN9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm5861F6VCN9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5861F6VCN9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5861F6VCN9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5861F6VCN9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5861F6VCN9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5861F6VCN9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5861F6VCN9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5861F6VCN9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5861F6VCN9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5861F6VCN9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5861F6VCN9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5861F6VCN9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5861F6VCN9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5861F6VCN9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5861F6VCN9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5861F6VCN9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5861F6VCN9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5861F6VCN9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5861F6VCN9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5861F6VCN9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5861F6VCN9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5861F6VCN9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5861F6VCN9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5861F6VCN9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5861F6VCN9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm5861F6VCN9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5861F6VCN9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5861F6VCN9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5861F6VCN9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5861F6VCN9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5861F6VCN9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5861F6VCN9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5861F6VCN9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5861F6VCN9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5861F6VCN9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5861F6VCN9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5861F6VCN9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5861F6VCN9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5861F6VCN9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5861F6VCN9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5861F6VCN9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5861F6VCN9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5861F6VCN9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5861F6VCN9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5861F6VCN9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5861F6VCN9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5861F6VCN9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5861F6VCN9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5861F6VCN9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5861F6VCN9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5861F6VCN9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5861F6VCN9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5861F6VCN9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5861F6VCN9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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