Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3072F6SKY8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3072F6SKY8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm3072F6SKY8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm3072F6SKY8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms