Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc7bE9Q9Y3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc7bE9Q9Y3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc7bE9Q9Y3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc7bE9Q9Y3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc7bE9Q9Y3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc7bE9Q9Y3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc7bE9Q9Y3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc7bE9Q9Y3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc7bE9Q9Y3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc7bE9Q9Y3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc7bE9Q9Y3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc7bE9Q9Y3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc7bE9Q9Y3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc7bE9Q9Y3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc7bE9Q9Y3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc7bE9Q9Y3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc7bE9Q9Y3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc7bE9Q9Y3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc7bE9Q9Y3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc7bE9Q9Y3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc7bE9Q9Y3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc7bE9Q9Y3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms