Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R7

Utrn, Utrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UtrnE9Q6R7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UtrnE9Q6R7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
UtrnE9Q6R7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UtrnE9Q6R7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UtrnE9Q6R7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UtrnE9Q6R7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UtrnE9Q6R7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UtrnE9Q6R7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
UtrnE9Q6R7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
UtrnE9Q6R7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UtrnE9Q6R7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UtrnE9Q6R7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
UtrnE9Q6R7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UtrnE9Q6R7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
UtrnE9Q6R7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UtrnE9Q6R7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UtrnE9Q6R7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UtrnE9Q6R7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UtrnE9Q6R7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UtrnE9Q6R7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
UtrnE9Q6R7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UtrnE9Q6R7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
UtrnE9Q6R7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UtrnE9Q6R7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
UtrnE9Q6R7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UtrnE9Q6R7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UtrnE9Q6R7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UtrnE9Q6R7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UtrnE9Q6R7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UtrnE9Q6R7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UtrnE9Q6R7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UtrnE9Q6R7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UtrnE9Q6R7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UtrnE9Q6R7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UtrnE9Q6R7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UtrnE9Q6R7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UtrnE9Q6R7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UtrnE9Q6R7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UtrnE9Q6R7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UtrnE9Q6R7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UtrnE9Q6R7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UtrnE9Q6R7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
UtrnE9Q6R7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
UtrnE9Q6R7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UtrnE9Q6R7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UtrnE9Q6R7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
UtrnE9Q6R7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UtrnE9Q6R7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UtrnE9Q6R7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UtrnE9Q6R7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
UtrnE9Q6R7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UtrnE9Q6R7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UtrnE9Q6R7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UtrnE9Q6R7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UtrnE9Q6R7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UtrnE9Q6R7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UtrnE9Q6R7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UtrnE9Q6R7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
UtrnE9Q6R7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
UtrnE9Q6R7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UtrnE9Q6R7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UtrnE9Q6R7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UtrnE9Q6R7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UtrnE9Q6R7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UtrnE9Q6R7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UtrnE9Q6R7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UtrnE9Q6R7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
UtrnE9Q6R7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UtrnE9Q6R7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UtrnE9Q6R7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UtrnE9Q6R7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UtrnE9Q6R7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UtrnE9Q6R7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UtrnE9Q6R7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UtrnE9Q6R7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UtrnE9Q6R7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UtrnE9Q6R7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UtrnE9Q6R7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UtrnE9Q6R7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UtrnE9Q6R7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UtrnE9Q6R7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UtrnE9Q6R7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UtrnE9Q6R7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
UtrnE9Q6R7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UtrnE9Q6R7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UtrnE9Q6R7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UtrnE9Q6R7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UtrnE9Q6R7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UtrnE9Q6R7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UtrnE9Q6R7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UtrnE9Q6R7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UtrnE9Q6R7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UtrnE9Q6R7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UtrnE9Q6R7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UtrnE9Q6R7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UtrnE9Q6R7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UtrnE9Q6R7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UtrnE9Q6R7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UtrnE9Q6R7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UtrnE9Q6R7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms