Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
BC005561E9Q5E2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
BC005561E9Q5E2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
BC005561E9Q5E2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
BC005561E9Q5E2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
BC005561E9Q5E2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
BC005561E9Q5E2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
BC005561E9Q5E2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
BC005561E9Q5E2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
BC005561E9Q5E2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
BC005561E9Q5E2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
BC005561E9Q5E2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
BC005561E9Q5E2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
BC005561E9Q5E2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
BC005561E9Q5E2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
BC005561E9Q5E2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
BC005561E9Q5E2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
BC005561E9Q5E2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
BC005561E9Q5E2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
BC005561E9Q5E2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
BC005561E9Q5E2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
BC005561E9Q5E2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
BC005561E9Q5E2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
BC005561E9Q5E2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
BC005561E9Q5E2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
BC005561E9Q5E2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
BC005561E9Q5E2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
BC005561E9Q5E2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
BC005561E9Q5E2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
BC005561E9Q5E2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
BC005561E9Q5E2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
BC005561E9Q5E2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
BC005561E9Q5E2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
BC005561E9Q5E2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
BC005561E9Q5E2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
BC005561E9Q5E2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
BC005561E9Q5E2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
BC005561E9Q5E2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
BC005561E9Q5E2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
BC005561E9Q5E2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
BC005561E9Q5E2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
BC005561E9Q5E2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
BC005561E9Q5E2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
BC005561E9Q5E2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
BC005561E9Q5E2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
BC005561E9Q5E2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
BC005561E9Q5E2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
BC005561E9Q5E2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
BC005561E9Q5E2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
BC005561E9Q5E2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
BC005561E9Q5E2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
BC005561E9Q5E2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
BC005561E9Q5E2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
BC005561E9Q5E2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
BC005561E9Q5E2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
BC005561E9Q5E2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
BC005561E9Q5E2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
BC005561E9Q5E2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
BC005561E9Q5E2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
BC005561E9Q5E2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
BC005561E9Q5E2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
BC005561E9Q5E2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
BC005561E9Q5E2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
BC005561E9Q5E2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
BC005561E9Q5E2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
BC005561E9Q5E2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
BC005561E9Q5E2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
BC005561E9Q5E2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
BC005561E9Q5E2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
BC005561E9Q5E2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
BC005561E9Q5E2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
BC005561E9Q5E2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
BC005561E9Q5E2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
BC005561E9Q5E2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
BC005561E9Q5E2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
BC005561E9Q5E2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
BC005561E9Q5E2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
BC005561E9Q5E2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
BC005561E9Q5E2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
BC005561E9Q5E2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
BC005561E9Q5E2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
BC005561E9Q5E2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
BC005561E9Q5E2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
BC005561E9Q5E2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
BC005561E9Q5E2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
BC005561E9Q5E2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
BC005561E9Q5E2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
BC005561E9Q5E2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
BC005561E9Q5E2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
BC005561E9Q5E2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
BC005561E9Q5E2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
BC005561E9Q5E2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
BC005561E9Q5E2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
BC005561E9Q5E2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
BC005561E9Q5E2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
BC005561E9Q5E2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
BC005561E9Q5E2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
BC005561E9Q5E2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
BC005561E9Q5E2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
BC005561E9Q5E2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms