Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4X4

Vmn2r11, Vomeronasal 2, receptor 11, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r11E9Q4X4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn2r11E9Q4X4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn2r11E9Q4X4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn2r11E9Q4X4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn2r11E9Q4X4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn2r11E9Q4X4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn2r11E9Q4X4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn2r11E9Q4X4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn2r11E9Q4X4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn2r11E9Q4X4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vmn2r11E9Q4X4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn2r11E9Q4X4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn2r11E9Q4X4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn2r11E9Q4X4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn2r11E9Q4X4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r11E9Q4X4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r11E9Q4X4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r11E9Q4X4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn2r11E9Q4X4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn2r11E9Q4X4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn2r11E9Q4X4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn2r11E9Q4X4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn2r11E9Q4X4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r11E9Q4X4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r11E9Q4X4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r11E9Q4X4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r11E9Q4X4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r11E9Q4X4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r11E9Q4X4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn2r11E9Q4X4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn2r11E9Q4X4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vmn2r11E9Q4X4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r11E9Q4X4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vmn2r11E9Q4X4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r11E9Q4X4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r11E9Q4X4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r11E9Q4X4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r11E9Q4X4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r11E9Q4X4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r11E9Q4X4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r11E9Q4X4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r11E9Q4X4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r11E9Q4X4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r11E9Q4X4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r11E9Q4X4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r11E9Q4X4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r11E9Q4X4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r11E9Q4X4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r11E9Q4X4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r11E9Q4X4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r11E9Q4X4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn2r11E9Q4X4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r11E9Q4X4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r11E9Q4X4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r11E9Q4X4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r11E9Q4X4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r11E9Q4X4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn2r11E9Q4X4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn2r11E9Q4X4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn2r11E9Q4X4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn2r11E9Q4X4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn2r11E9Q4X4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn2r11E9Q4X4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn2r11E9Q4X4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn2r11E9Q4X4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn2r11E9Q4X4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn2r11E9Q4X4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn2r11E9Q4X4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn2r11E9Q4X4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms