Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc4E9Q236 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Abcc4E9Q236 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abcc4E9Q236 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Abcc4E9Q236 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Abcc4E9Q236 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Abcc4E9Q236 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc4E9Q236 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc4E9Q236 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc4E9Q236 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcc4E9Q236 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcc4E9Q236 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc4E9Q236 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc4E9Q236 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc4E9Q236 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcc4E9Q236 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abcc4E9Q236 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abcc4E9Q236 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abcc4E9Q236 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abcc4E9Q236 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Abcc4E9Q236 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Abcc4E9Q236 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Abcc4E9Q236 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc4E9Q236 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc4E9Q236 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc4E9Q236 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc4E9Q236 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc4E9Q236 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc4E9Q236 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc4E9Q236 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc4E9Q236 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc4E9Q236 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc4E9Q236 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc4E9Q236 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc4E9Q236 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc4E9Q236 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc4E9Q236 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc4E9Q236 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc4E9Q236 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc4E9Q236 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc4E9Q236 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc4E9Q236 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc4E9Q236 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc4E9Q236 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc4E9Q236 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc4E9Q236 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc4E9Q236 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Abcc4E9Q236 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Abcc4E9Q236 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Abcc4E9Q236 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Abcc4E9Q236 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc4E9Q236 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc4E9Q236 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc4E9Q236 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc4E9Q236 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcc4E9Q236 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcc4E9Q236 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcc4E9Q236 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcc4E9Q236 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcc4E9Q236 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcc4E9Q236 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Abcc4E9Q236 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Abcc4E9Q236 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Abcc4E9Q236 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abcc4E9Q236 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abcc4E9Q236 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abcc4E9Q236 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abcc4E9Q236 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abcc4E9Q236 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abcc4E9Q236 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Abcc4E9Q236 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms