Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1X6

6430550D23Rik, RIKEN cDNA 6430550D23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430550D23RikE9Q1X6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430550D23RikE9Q1X6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430550D23RikE9Q1X6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430550D23RikE9Q1X6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
6430550D23RikE9Q1X6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430550D23RikE9Q1X6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
6430550D23RikE9Q1X6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430550D23RikE9Q1X6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430550D23RikE9Q1X6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430550D23RikE9Q1X6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430550D23RikE9Q1X6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
6430550D23RikE9Q1X6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430550D23RikE9Q1X6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430550D23RikE9Q1X6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430550D23RikE9Q1X6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
6430550D23RikE9Q1X6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6430550D23RikE9Q1X6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6430550D23RikE9Q1X6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
6430550D23RikE9Q1X6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
6430550D23RikE9Q1X6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
6430550D23RikE9Q1X6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
6430550D23RikE9Q1X6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms