Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0P0

Gm8127, Predicted gene 8127, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8127E9Q0P0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm8127E9Q0P0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm8127E9Q0P0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8127E9Q0P0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8127E9Q0P0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8127E9Q0P0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8127E9Q0P0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm8127E9Q0P0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm8127E9Q0P0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm8127E9Q0P0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm8127E9Q0P0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8127E9Q0P0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8127E9Q0P0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8127E9Q0P0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8127E9Q0P0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8127E9Q0P0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8127E9Q0P0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8127E9Q0P0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8127E9Q0P0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8127E9Q0P0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8127E9Q0P0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8127E9Q0P0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8127E9Q0P0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8127E9Q0P0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8127E9Q0P0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8127E9Q0P0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8127E9Q0P0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8127E9Q0P0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8127E9Q0P0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8127E9Q0P0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8127E9Q0P0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8127E9Q0P0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8127E9Q0P0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8127E9Q0P0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8127E9Q0P0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8127E9Q0P0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8127E9Q0P0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8127E9Q0P0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8127E9Q0P0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms