Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rsph10bE9PYQ0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rsph10bE9PYQ0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsph10bE9PYQ0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsph10bE9PYQ0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsph10bE9PYQ0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsph10bE9PYQ0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsph10bE9PYQ0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsph10bE9PYQ0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsph10bE9PYQ0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsph10bE9PYQ0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsph10bE9PYQ0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsph10bE9PYQ0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsph10bE9PYQ0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsph10bE9PYQ0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsph10bE9PYQ0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsph10bE9PYQ0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rsph10bE9PYQ0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rsph10bE9PYQ0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rsph10bE9PYQ0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rsph10bE9PYQ0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rsph10bE9PYQ0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Rsph10bE9PYQ0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rsph10bE9PYQ0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rsph10bE9PYQ0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rsph10bE9PYQ0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rsph10bE9PYQ0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rsph10bE9PYQ0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rsph10bE9PYQ0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rsph10bE9PYQ0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rsph10bE9PYQ0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rsph10bE9PYQ0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rsph10bE9PYQ0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rsph10bE9PYQ0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rsph10bE9PYQ0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rsph10bE9PYQ0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rsph10bE9PYQ0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rsph10bE9PYQ0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rsph10bE9PYQ0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rsph10bE9PYQ0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rsph10bE9PYQ0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsph10bE9PYQ0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rsph10bE9PYQ0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rsph10bE9PYQ0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rsph10bE9PYQ0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rsph10bE9PYQ0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rsph10bE9PYQ0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rsph10bE9PYQ0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsph10bE9PYQ0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsph10bE9PYQ0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rsph10bE9PYQ0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsph10bE9PYQ0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsph10bE9PYQ0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsph10bE9PYQ0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsph10bE9PYQ0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rsph10bE9PYQ0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsph10bE9PYQ0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rsph10bE9PYQ0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rsph10bE9PYQ0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rsph10bE9PYQ0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rsph10bE9PYQ0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rsph10bE9PYQ0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rsph10bE9PYQ0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rsph10bE9PYQ0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rsph10bE9PYQ0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rsph10bE9PYQ0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rsph10bE9PYQ0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rsph10bE9PYQ0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rsph10bE9PYQ0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rsph10bE9PYQ0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rsph10bE9PYQ0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms