Protein–RNA interactions for Protein: E9PWJ7

Abca16, ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca16E9PWJ7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Abca16E9PWJ7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Abca16E9PWJ7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Abca16E9PWJ7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Abca16E9PWJ7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Abca16E9PWJ7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Abca16E9PWJ7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Abca16E9PWJ7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Abca16E9PWJ7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Abca16E9PWJ7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Abca16E9PWJ7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Abca16E9PWJ7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Abca16E9PWJ7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Abca16E9PWJ7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Abca16E9PWJ7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Abca16E9PWJ7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Abca16E9PWJ7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Abca16E9PWJ7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Abca16E9PWJ7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Abca16E9PWJ7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Abca16E9PWJ7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Abca16E9PWJ7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Abca16E9PWJ7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Abca16E9PWJ7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Abca16E9PWJ7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Abca16E9PWJ7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Abca16E9PWJ7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Abca16E9PWJ7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.42
Abca16E9PWJ7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Abca16E9PWJ7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Abca16E9PWJ7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Abca16E9PWJ7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Abca16E9PWJ7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Abca16E9PWJ7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Abca16E9PWJ7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Abca16E9PWJ7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Abca16E9PWJ7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Abca16E9PWJ7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Abca16E9PWJ7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Abca16E9PWJ7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Abca16E9PWJ7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Abca16E9PWJ7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Abca16E9PWJ7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Abca16E9PWJ7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
Abca16E9PWJ7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Abca16E9PWJ7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Abca16E9PWJ7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Abca16E9PWJ7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Abca16E9PWJ7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Abca16E9PWJ7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Abca16E9PWJ7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Abca16E9PWJ7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Abca16E9PWJ7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Abca16E9PWJ7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Abca16E9PWJ7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Abca16E9PWJ7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Abca16E9PWJ7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Abca16E9PWJ7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Abca16E9PWJ7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abca16E9PWJ7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abca16E9PWJ7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Abca16E9PWJ7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Abca16E9PWJ7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abca16E9PWJ7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Abca16E9PWJ7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Abca16E9PWJ7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Abca16E9PWJ7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Abca16E9PWJ7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Abca16E9PWJ7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Abca16E9PWJ7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Abca16E9PWJ7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Abca16E9PWJ7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Abca16E9PWJ7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abca16E9PWJ7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abca16E9PWJ7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abca16E9PWJ7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abca16E9PWJ7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Abca16E9PWJ7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Abca16E9PWJ7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Abca16E9PWJ7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Abca16E9PWJ7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Abca16E9PWJ7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Abca16E9PWJ7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Abca16E9PWJ7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Abca16E9PWJ7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Abca16E9PWJ7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Abca16E9PWJ7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Abca16E9PWJ7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Abca16E9PWJ7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Abca16E9PWJ7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Abca16E9PWJ7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Abca16E9PWJ7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Abca16E9PWJ7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Abca16E9PWJ7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Abca16E9PWJ7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Abca16E9PWJ7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Abca16E9PWJ7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Abca16E9PWJ7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Abca16E9PWJ7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Abca16E9PWJ7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms