Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim5E9PV98 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim5E9PV98 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim5E9PV98 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim5E9PV98 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim5E9PV98 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim5E9PV98 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trim5E9PV98 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim5E9PV98 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim5E9PV98 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim5E9PV98 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim5E9PV98 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim5E9PV98 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim5E9PV98 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim5E9PV98 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim5E9PV98 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim5E9PV98 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim5E9PV98 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim5E9PV98 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim5E9PV98 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim5E9PV98 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim5E9PV98 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim5E9PV98 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim5E9PV98 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim5E9PV98 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim5E9PV98 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim5E9PV98 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim5E9PV98 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim5E9PV98 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim5E9PV98 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim5E9PV98 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim5E9PV98 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim5E9PV98 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim5E9PV98 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim5E9PV98 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim5E9PV98 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim5E9PV98 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim5E9PV98 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim5E9PV98 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim5E9PV98 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim5E9PV98 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim5E9PV98 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim5E9PV98 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim5E9PV98 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim5E9PV98 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim5E9PV98 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim5E9PV98 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim5E9PV98 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim5E9PV98 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim5E9PV98 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim5E9PV98 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim5E9PV98 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim5E9PV98 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim5E9PV98 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim5E9PV98 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim5E9PV98 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim5E9PV98 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim5E9PV98 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim5E9PV98 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim5E9PV98 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim5E9PV98 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim5E9PV98 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim5E9PV98 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim5E9PV98 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim5E9PV98 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim5E9PV98 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim5E9PV98 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim5E9PV98 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim5E9PV98 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim5E9PV98 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim5E9PV98 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim5E9PV98 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim5E9PV98 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim5E9PV98 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim5E9PV98 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim5E9PV98 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim5E9PV98 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim5E9PV98 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim5E9PV98 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim5E9PV98 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim5E9PV98 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim5E9PV98 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim5E9PV98 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim5E9PV98 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim5E9PV98 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim5E9PV98 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trim5E9PV98 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim5E9PV98 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim5E9PV98 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim5E9PV98 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim5E9PV98 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim5E9PV98 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim5E9PV98 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim5E9PV98 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim5E9PV98 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim5E9PV98 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim5E9PV98 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim5E9PV98 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim5E9PV98 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim5E9PV98 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms