Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifit3bE9PV48 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifit3bE9PV48 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifit3bE9PV48 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifit3bE9PV48 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifit3bE9PV48 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifit3bE9PV48 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifit3bE9PV48 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifit3bE9PV48 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifit3bE9PV48 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifit3bE9PV48 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifit3bE9PV48 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifit3bE9PV48 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ifit3bE9PV48 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifit3bE9PV48 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifit3bE9PV48 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifit3bE9PV48 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ifit3bE9PV48 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifit3bE9PV48 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifit3bE9PV48 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifit3bE9PV48 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifit3bE9PV48 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifit3bE9PV48 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifit3bE9PV48 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ifit3bE9PV48 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifit3bE9PV48 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ifit3bE9PV48 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifit3bE9PV48 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifit3bE9PV48 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifit3bE9PV48 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ifit3bE9PV48 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifit3bE9PV48 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifit3bE9PV48 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ifit3bE9PV48 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifit3bE9PV48 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ifit3bE9PV48 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifit3bE9PV48 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifit3bE9PV48 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ifit3bE9PV48 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifit3bE9PV48 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ifit3bE9PV48 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifit3bE9PV48 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifit3bE9PV48 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifit3bE9PV48 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifit3bE9PV48 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifit3bE9PV48 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifit3bE9PV48 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifit3bE9PV48 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifit3bE9PV48 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifit3bE9PV48 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifit3bE9PV48 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifit3bE9PV48 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifit3bE9PV48 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifit3bE9PV48 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifit3bE9PV48 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifit3bE9PV48 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifit3bE9PV48 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifit3bE9PV48 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifit3bE9PV48 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifit3bE9PV48 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifit3bE9PV48 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms