Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc6D3YZP9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc6D3YZP9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc6D3YZP9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc6D3YZP9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc6D3YZP9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc6D3YZP9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc6D3YZP9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc6D3YZP9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc6D3YZP9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc6D3YZP9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc6D3YZP9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc6D3YZP9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc6D3YZP9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc6D3YZP9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc6D3YZP9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc6D3YZP9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc6D3YZP9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc6D3YZP9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc6D3YZP9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc6D3YZP9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc6D3YZP9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc6D3YZP9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc6D3YZP9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc6D3YZP9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc6D3YZP9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc6D3YZP9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc6D3YZP9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc6D3YZP9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc6D3YZP9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc6D3YZP9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc6D3YZP9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc6D3YZP9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc6D3YZP9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc6D3YZP9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc6D3YZP9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc6D3YZP9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc6D3YZP9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc6D3YZP9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ccdc6D3YZP9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc6D3YZP9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc6D3YZP9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc6D3YZP9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc6D3YZP9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc6D3YZP9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc6D3YZP9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc6D3YZP9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc6D3YZP9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc6D3YZP9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc6D3YZP9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc6D3YZP9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc6D3YZP9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc6D3YZP9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc6D3YZP9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc6D3YZP9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc6D3YZP9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc6D3YZP9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc6D3YZP9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc6D3YZP9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc6D3YZP9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc6D3YZP9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ccdc6D3YZP9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc6D3YZP9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc6D3YZP9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc6D3YZP9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc6D3YZP9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc6D3YZP9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc6D3YZP9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc6D3YZP9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc6D3YZP9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc6D3YZP9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc6D3YZP9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc6D3YZP9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc6D3YZP9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc6D3YZP9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc6D3YZP9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc6D3YZP9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc6D3YZP9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc6D3YZP9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc6D3YZP9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc6D3YZP9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc6D3YZP9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc6D3YZP9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc6D3YZP9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc6D3YZP9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc6D3YZP9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc6D3YZP9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc6D3YZP9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc6D3YZP9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc6D3YZP9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc6D3YZP9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc6D3YZP9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc6D3YZP9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc6D3YZP9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc6D3YZP9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc6D3YZP9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc6D3YZP9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc6D3YZP9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc6D3YZP9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc6D3YZP9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms