Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Otud7bB2RUR8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Otud7bB2RUR8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Otud7bB2RUR8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Otud7bB2RUR8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Otud7bB2RUR8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Otud7bB2RUR8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Otud7bB2RUR8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Otud7bB2RUR8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Otud7bB2RUR8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Otud7bB2RUR8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Otud7bB2RUR8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Otud7bB2RUR8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Otud7bB2RUR8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Otud7bB2RUR8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Otud7bB2RUR8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Otud7bB2RUR8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Otud7bB2RUR8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Otud7bB2RUR8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Otud7bB2RUR8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Otud7bB2RUR8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Otud7bB2RUR8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Otud7bB2RUR8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Otud7bB2RUR8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Otud7bB2RUR8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Otud7bB2RUR8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Otud7bB2RUR8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Otud7bB2RUR8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Otud7bB2RUR8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Otud7bB2RUR8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Otud7bB2RUR8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Otud7bB2RUR8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Otud7bB2RUR8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Otud7bB2RUR8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Otud7bB2RUR8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Otud7bB2RUR8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Otud7bB2RUR8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Otud7bB2RUR8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Otud7bB2RUR8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Otud7bB2RUR8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Otud7bB2RUR8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Otud7bB2RUR8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Otud7bB2RUR8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Otud7bB2RUR8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Otud7bB2RUR8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Otud7bB2RUR8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Otud7bB2RUR8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Otud7bB2RUR8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Otud7bB2RUR8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Otud7bB2RUR8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Otud7bB2RUR8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Otud7bB2RUR8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Otud7bB2RUR8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Otud7bB2RUR8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Otud7bB2RUR8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Otud7bB2RUR8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Otud7bB2RUR8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Otud7bB2RUR8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Otud7bB2RUR8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Otud7bB2RUR8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Otud7bB2RUR8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Otud7bB2RUR8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Otud7bB2RUR8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Otud7bB2RUR8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Otud7bB2RUR8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms