Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud4B2RRE7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud4B2RRE7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud4B2RRE7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Otud4B2RRE7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud4B2RRE7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud4B2RRE7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud4B2RRE7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Otud4B2RRE7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Otud4B2RRE7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud4B2RRE7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Otud4B2RRE7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Otud4B2RRE7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud4B2RRE7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud4B2RRE7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otud4B2RRE7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otud4B2RRE7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otud4B2RRE7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Otud4B2RRE7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otud4B2RRE7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud4B2RRE7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Otud4B2RRE7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud4B2RRE7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otud4B2RRE7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otud4B2RRE7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Otud4B2RRE7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Otud4B2RRE7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Otud4B2RRE7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Otud4B2RRE7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Otud4B2RRE7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Otud4B2RRE7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud4B2RRE7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud4B2RRE7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud4B2RRE7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud4B2RRE7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud4B2RRE7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud4B2RRE7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud4B2RRE7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud4B2RRE7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud4B2RRE7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud4B2RRE7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud4B2RRE7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud4B2RRE7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud4B2RRE7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud4B2RRE7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud4B2RRE7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud4B2RRE7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud4B2RRE7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otud4B2RRE7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otud4B2RRE7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otud4B2RRE7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otud4B2RRE7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otud4B2RRE7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otud4B2RRE7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otud4B2RRE7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otud4B2RRE7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Otud4B2RRE7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Otud4B2RRE7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Otud4B2RRE7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Otud4B2RRE7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otud4B2RRE7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otud4B2RRE7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Otud4B2RRE7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otud4B2RRE7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otud4B2RRE7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Otud4B2RRE7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otud4B2RRE7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Otud4B2RRE7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Otud4B2RRE7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms