Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BC035947B2RQY6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BC035947B2RQY6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BC035947B2RQY6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BC035947B2RQY6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BC035947B2RQY6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BC035947B2RQY6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BC035947B2RQY6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BC035947B2RQY6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BC035947B2RQY6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BC035947B2RQY6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BC035947B2RQY6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BC035947B2RQY6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BC035947B2RQY6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BC035947B2RQY6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BC035947B2RQY6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BC035947B2RQY6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BC035947B2RQY6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BC035947B2RQY6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BC035947B2RQY6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BC035947B2RQY6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BC035947B2RQY6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BC035947B2RQY6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BC035947B2RQY6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BC035947B2RQY6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BC035947B2RQY6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BC035947B2RQY6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BC035947B2RQY6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BC035947B2RQY6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BC035947B2RQY6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BC035947B2RQY6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BC035947B2RQY6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BC035947B2RQY6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BC035947B2RQY6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BC035947B2RQY6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
BC035947B2RQY6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BC035947B2RQY6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BC035947B2RQY6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BC035947B2RQY6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BC035947B2RQY6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BC035947B2RQY6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BC035947B2RQY6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BC035947B2RQY6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BC035947B2RQY6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BC035947B2RQY6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BC035947B2RQY6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BC035947B2RQY6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BC035947B2RQY6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BC035947B2RQY6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BC035947B2RQY6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BC035947B2RQY6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BC035947B2RQY6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BC035947B2RQY6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BC035947B2RQY6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BC035947B2RQY6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BC035947B2RQY6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BC035947B2RQY6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BC035947B2RQY6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BC035947B2RQY6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms