Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PtpruB1AUH1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PtpruB1AUH1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PtpruB1AUH1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
PtpruB1AUH1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
PtpruB1AUH1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PtpruB1AUH1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PtpruB1AUH1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PtpruB1AUH1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PtpruB1AUH1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PtpruB1AUH1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtpruB1AUH1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtpruB1AUH1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtpruB1AUH1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PtpruB1AUH1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
PtpruB1AUH1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PtpruB1AUH1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PtpruB1AUH1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PtpruB1AUH1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PtpruB1AUH1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PtpruB1AUH1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PtpruB1AUH1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PtpruB1AUH1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PtpruB1AUH1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PtpruB1AUH1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PtpruB1AUH1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PtpruB1AUH1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtpruB1AUH1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtpruB1AUH1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtpruB1AUH1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtpruB1AUH1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PtpruB1AUH1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PtpruB1AUH1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PtpruB1AUH1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PtpruB1AUH1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PtpruB1AUH1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PtpruB1AUH1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PtpruB1AUH1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PtpruB1AUH1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PtpruB1AUH1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PtpruB1AUH1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PtpruB1AUH1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PtpruB1AUH1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PtpruB1AUH1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtpruB1AUH1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtpruB1AUH1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PtpruB1AUH1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PtpruB1AUH1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PtpruB1AUH1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
PtpruB1AUH1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PtpruB1AUH1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PtpruB1AUH1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PtpruB1AUH1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PtpruB1AUH1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PtpruB1AUH1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
PtpruB1AUH1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PtpruB1AUH1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PtpruB1AUH1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PtpruB1AUH1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PtpruB1AUH1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PtpruB1AUH1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PtpruB1AUH1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PtpruB1AUH1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PtpruB1AUH1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PtpruB1AUH1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PtpruB1AUH1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PtpruB1AUH1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PtpruB1AUH1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PtpruB1AUH1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PtpruB1AUH1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PtpruB1AUH1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PtpruB1AUH1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.57
PtpruB1AUH1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PtpruB1AUH1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PtpruB1AUH1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PtpruB1AUH1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PtpruB1AUH1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PtpruB1AUH1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PtpruB1AUH1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PtpruB1AUH1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PtpruB1AUH1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PtpruB1AUH1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PtpruB1AUH1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PtpruB1AUH1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PtpruB1AUH1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PtpruB1AUH1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PtpruB1AUH1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PtpruB1AUH1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PtpruB1AUH1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
PtpruB1AUH1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PtpruB1AUH1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PtpruB1AUH1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PtpruB1AUH1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PtpruB1AUH1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PtpruB1AUH1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PtpruB1AUH1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PtpruB1AUH1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PtpruB1AUH1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PtpruB1AUH1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PtpruB1AUH1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
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