Protein–RNA interactions for Protein: B1ATX6

Fam46d, Family with sequence similarity 46, member D, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46dB1ATX6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam46dB1ATX6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam46dB1ATX6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam46dB1ATX6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam46dB1ATX6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam46dB1ATX6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam46dB1ATX6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam46dB1ATX6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam46dB1ATX6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam46dB1ATX6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam46dB1ATX6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam46dB1ATX6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam46dB1ATX6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam46dB1ATX6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam46dB1ATX6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam46dB1ATX6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam46dB1ATX6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam46dB1ATX6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam46dB1ATX6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam46dB1ATX6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam46dB1ATX6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam46dB1ATX6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam46dB1ATX6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam46dB1ATX6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam46dB1ATX6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam46dB1ATX6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam46dB1ATX6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam46dB1ATX6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam46dB1ATX6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam46dB1ATX6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam46dB1ATX6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam46dB1ATX6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam46dB1ATX6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam46dB1ATX6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam46dB1ATX6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam46dB1ATX6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam46dB1ATX6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam46dB1ATX6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam46dB1ATX6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam46dB1ATX6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam46dB1ATX6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam46dB1ATX6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam46dB1ATX6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam46dB1ATX6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam46dB1ATX6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam46dB1ATX6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam46dB1ATX6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam46dB1ATX6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam46dB1ATX6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam46dB1ATX6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam46dB1ATX6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam46dB1ATX6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam46dB1ATX6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam46dB1ATX6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam46dB1ATX6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam46dB1ATX6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam46dB1ATX6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam46dB1ATX6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam46dB1ATX6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam46dB1ATX6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam46dB1ATX6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam46dB1ATX6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam46dB1ATX6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam46dB1ATX6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam46dB1ATX6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam46dB1ATX6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam46dB1ATX6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam46dB1ATX6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam46dB1ATX6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam46dB1ATX6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms