Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhox1B1APN4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhox1B1APN4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhox1B1APN4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhox1B1APN4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhox1B1APN4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhox1B1APN4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhox1B1APN4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhox1B1APN4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhox1B1APN4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhox1B1APN4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhox1B1APN4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhox1B1APN4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhox1B1APN4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhox1B1APN4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rhox1B1APN4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhox1B1APN4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhox1B1APN4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhox1B1APN4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhox1B1APN4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhox1B1APN4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhox1B1APN4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhox1B1APN4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhox1B1APN4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhox1B1APN4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhox1B1APN4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhox1B1APN4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhox1B1APN4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhox1B1APN4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox1B1APN4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox1B1APN4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox1B1APN4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox1B1APN4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox1B1APN4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox1B1APN4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox1B1APN4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhox1B1APN4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhox1B1APN4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhox1B1APN4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox1B1APN4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox1B1APN4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms