Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms