Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Skint2A7XUX6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Skint2A7XUX6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Skint2A7XUX6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms