Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930435E12RikA6X8Z9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930435E12RikA6X8Z9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930435E12RikA6X8Z9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4930435E12RikA6X8Z9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms