Protein–RNA interactions for Protein: A6X8J1

Gm16430, Predicted gene 16405, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16430A6X8J1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm16430A6X8J1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm16430A6X8J1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm16430A6X8J1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm16430A6X8J1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm16430A6X8J1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm16430A6X8J1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm16430A6X8J1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm16430A6X8J1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm16430A6X8J1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm16430A6X8J1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm16430A6X8J1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm16430A6X8J1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm16430A6X8J1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm16430A6X8J1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm16430A6X8J1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm16430A6X8J1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm16430A6X8J1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm16430A6X8J1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm16430A6X8J1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm16430A6X8J1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm16430A6X8J1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm16430A6X8J1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm16430A6X8J1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm16430A6X8J1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm16430A6X8J1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm16430A6X8J1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm16430A6X8J1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm16430A6X8J1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm16430A6X8J1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm16430A6X8J1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm16430A6X8J1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm16430A6X8J1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm16430A6X8J1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm16430A6X8J1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm16430A6X8J1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm16430A6X8J1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm16430A6X8J1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm16430A6X8J1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm16430A6X8J1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm16430A6X8J1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm16430A6X8J1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm16430A6X8J1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm16430A6X8J1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm16430A6X8J1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm16430A6X8J1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm16430A6X8J1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm16430A6X8J1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm16430A6X8J1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm16430A6X8J1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm16430A6X8J1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm16430A6X8J1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm16430A6X8J1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm16430A6X8J1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm16430A6X8J1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm16430A6X8J1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm16430A6X8J1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm16430A6X8J1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm16430A6X8J1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm16430A6X8J1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm16430A6X8J1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm16430A6X8J1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm16430A6X8J1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm16430A6X8J1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm16430A6X8J1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm16430A6X8J1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm16430A6X8J1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm16430A6X8J1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm16430A6X8J1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm16430A6X8J1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm16430A6X8J1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm16430A6X8J1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm16430A6X8J1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm16430A6X8J1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm16430A6X8J1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm16430A6X8J1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm16430A6X8J1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm16430A6X8J1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm16430A6X8J1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm16430A6X8J1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm16430A6X8J1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm16430A6X8J1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm16430A6X8J1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm16430A6X8J1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm16430A6X8J1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm16430A6X8J1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm16430A6X8J1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm16430A6X8J1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm16430A6X8J1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm16430A6X8J1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm16430A6X8J1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm16430A6X8J1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm16430A6X8J1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm16430A6X8J1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm16430A6X8J1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm16430A6X8J1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm16430A6X8J1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm16430A6X8J1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm16430A6X8J1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm16430A6X8J1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms