Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm6880A3KG45 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm6880A3KG45 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm6880A3KG45 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm6880A3KG45 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm6880A3KG45 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm6880A3KG45 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm6880A3KG45 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm6880A3KG45 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm6880A3KG45 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm6880A3KG45 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm6880A3KG45 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm6880A3KG45 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm6880A3KG45 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm6880A3KG45 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm6880A3KG45 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm6880A3KG45 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm6880A3KG45 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6880A3KG45 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6880A3KG45 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6880A3KG45 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6880A3KG45 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6880A3KG45 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm6880A3KG45 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm6880A3KG45 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm6880A3KG45 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm6880A3KG45 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm6880A3KG45 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm6880A3KG45 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm6880A3KG45 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm6880A3KG45 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm6880A3KG45 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm6880A3KG45 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm6880A3KG45 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm6880A3KG45 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm6880A3KG45 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm6880A3KG45 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm6880A3KG45 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm6880A3KG45 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm6880A3KG45 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm6880A3KG45 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm6880A3KG45 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm6880A3KG45 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm6880A3KG45 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm6880A3KG45 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm6880A3KG45 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm6880A3KG45 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm6880A3KG45 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm6880A3KG45 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm6880A3KG45 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm6880A3KG45 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm6880A3KG45 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm6880A3KG45 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm6880A3KG45 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm6880A3KG45 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm6880A3KG45 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm6880A3KG45 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm6880A3KG45 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm6880A3KG45 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gm6880A3KG45 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm6880A3KG45 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm6880A3KG45 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gm6880A3KG45 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm6880A3KG45 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm6880A3KG45 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm6880A3KG45 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm6880A3KG45 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm6880A3KG45 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm6880A3KG45 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm6880A3KG45 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm6880A3KG45 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6880A3KG45 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6880A3KG45 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6880A3KG45 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6880A3KG45 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6880A3KG45 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm6880A3KG45 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm6880A3KG45 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm6880A3KG45 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm6880A3KG45 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm6880A3KG45 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm6880A3KG45 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm6880A3KG45 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm6880A3KG45 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm6880A3KG45 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm6880A3KG45 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm6880A3KG45 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm6880A3KG45 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm6880A3KG45 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm6880A3KG45 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm6880A3KG45 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm6880A3KG45 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm6880A3KG45 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm6880A3KG45 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm6880A3KG45 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm6880A3KG45 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm6880A3KG45 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm6880A3KG45 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm6880A3KG45 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm6880A3KG45 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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