Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samt1A2BED8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samt1A2BED8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samt1A2BED8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samt1A2BED8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1190.9 ms