Protein–RNA interactions for Protein: A2AJN7

Slc4a11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a11A2AJN7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc4a11A2AJN7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a11A2AJN7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a11A2AJN7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a11A2AJN7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a11A2AJN7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a11A2AJN7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a11A2AJN7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a11A2AJN7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a11A2AJN7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a11A2AJN7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a11A2AJN7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc4a11A2AJN7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc4a11A2AJN7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc4a11A2AJN7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc4a11A2AJN7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc4a11A2AJN7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc4a11A2AJN7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc4a11A2AJN7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc4a11A2AJN7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc4a11A2AJN7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc4a11A2AJN7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc4a11A2AJN7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc4a11A2AJN7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc4a11A2AJN7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc4a11A2AJN7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc4a11A2AJN7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc4a11A2AJN7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc4a11A2AJN7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc4a11A2AJN7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc4a11A2AJN7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc4a11A2AJN7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc4a11A2AJN7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc4a11A2AJN7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc4a11A2AJN7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc4a11A2AJN7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc4a11A2AJN7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc4a11A2AJN7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms