Protein–RNA interactions for Protein: A2AHC3

Camsap1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap1A2AHC3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
Camsap1A2AHC3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Camsap1A2AHC3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Camsap1A2AHC3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Camsap1A2AHC3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Camsap1A2AHC3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Camsap1A2AHC3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Camsap1A2AHC3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Camsap1A2AHC3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Camsap1A2AHC3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Camsap1A2AHC3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Camsap1A2AHC3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Camsap1A2AHC3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
Camsap1A2AHC3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Camsap1A2AHC3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Camsap1A2AHC3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Camsap1A2AHC3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC38.26■■■■□ 3.71
Camsap1A2AHC3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC38.26■■■■□ 3.71
Camsap1A2AHC3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Camsap1A2AHC3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
Camsap1A2AHC3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Camsap1A2AHC3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Camsap1A2AHC3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Camsap1A2AHC3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Camsap1A2AHC3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Camsap1A2AHC3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Camsap1A2AHC3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Camsap1A2AHC3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Camsap1A2AHC3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
Camsap1A2AHC3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Camsap1A2AHC3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Camsap1A2AHC3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Camsap1A2AHC3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Camsap1A2AHC3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Camsap1A2AHC3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Camsap1A2AHC3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Camsap1A2AHC3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Camsap1A2AHC3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Camsap1A2AHC3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Camsap1A2AHC3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Camsap1A2AHC3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Camsap1A2AHC3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Camsap1A2AHC3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Camsap1A2AHC3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Camsap1A2AHC3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Camsap1A2AHC3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Camsap1A2AHC3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Camsap1A2AHC3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Camsap1A2AHC3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Camsap1A2AHC3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Camsap1A2AHC3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Camsap1A2AHC3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
Camsap1A2AHC3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Camsap1A2AHC3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Camsap1A2AHC3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Camsap1A2AHC3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Camsap1A2AHC3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Camsap1A2AHC3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Camsap1A2AHC3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Camsap1A2AHC3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Camsap1A2AHC3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Camsap1A2AHC3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Camsap1A2AHC3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Camsap1A2AHC3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Camsap1A2AHC3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Camsap1A2AHC3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Camsap1A2AHC3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
Camsap1A2AHC3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Camsap1A2AHC3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Camsap1A2AHC3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Camsap1A2AHC3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Camsap1A2AHC3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Camsap1A2AHC3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Camsap1A2AHC3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
Camsap1A2AHC3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Camsap1A2AHC3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Camsap1A2AHC3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Camsap1A2AHC3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Camsap1A2AHC3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Camsap1A2AHC3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Camsap1A2AHC3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Camsap1A2AHC3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Camsap1A2AHC3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
Camsap1A2AHC3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Camsap1A2AHC3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Camsap1A2AHC3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Camsap1A2AHC3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Camsap1A2AHC3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Camsap1A2AHC3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Camsap1A2AHC3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Camsap1A2AHC3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Camsap1A2AHC3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Camsap1A2AHC3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Camsap1A2AHC3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Camsap1A2AHC3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Camsap1A2AHC3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Camsap1A2AHC3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Camsap1A2AHC3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Camsap1A2AHC3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Camsap1A2AHC3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms