Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700023F06RikA2AB62 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700023F06RikA2AB62 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700023F06RikA2AB62 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700023F06RikA2AB62 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700023F06RikA2AB62 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700023F06RikA2AB62 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
1700023F06RikA2AB62 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700023F06RikA2AB62 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700023F06RikA2AB62 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700023F06RikA2AB62 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700023F06RikA2AB62 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700023F06RikA2AB62 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700023F06RikA2AB62 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700023F06RikA2AB62 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700023F06RikA2AB62 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700023F06RikA2AB62 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700023F06RikA2AB62 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700023F06RikA2AB62 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700023F06RikA2AB62 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
1700023F06RikA2AB62 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
1700023F06RikA2AB62 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
1700023F06RikA2AB62 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
1700023F06RikA2AB62 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
1700023F06RikA2AB62 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
1700023F06RikA2AB62 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
1700023F06RikA2AB62 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700023F06RikA2AB62 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700023F06RikA2AB62 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700023F06RikA2AB62 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700023F06RikA2AB62 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
1700023F06RikA2AB62 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
1700023F06RikA2AB62 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
1700023F06RikA2AB62 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700023F06RikA2AB62 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700023F06RikA2AB62 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
1700023F06RikA2AB62 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms