Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Itgb4A2A863 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Itgb4A2A863 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Itgb4A2A863 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Itgb4A2A863 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Itgb4A2A863 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Itgb4A2A863 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Itgb4A2A863 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Itgb4A2A863 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Itgb4A2A863 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Itgb4A2A863 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Itgb4A2A863 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Itgb4A2A863 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Itgb4A2A863 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Itgb4A2A863 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Itgb4A2A863 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Itgb4A2A863 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Itgb4A2A863 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Itgb4A2A863 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Itgb4A2A863 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Itgb4A2A863 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Itgb4A2A863 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Itgb4A2A863 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Itgb4A2A863 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Itgb4A2A863 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Itgb4A2A863 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Itgb4A2A863 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Itgb4A2A863 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Itgb4A2A863 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Itgb4A2A863 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Itgb4A2A863 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Itgb4A2A863 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Itgb4A2A863 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Itgb4A2A863 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Itgb4A2A863 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Itgb4A2A863 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Itgb4A2A863 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Itgb4A2A863 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Itgb4A2A863 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Itgb4A2A863 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Itgb4A2A863 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Itgb4A2A863 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Itgb4A2A863 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Itgb4A2A863 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Itgb4A2A863 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Itgb4A2A863 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Itgb4A2A863 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Itgb4A2A863 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Itgb4A2A863 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Itgb4A2A863 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Itgb4A2A863 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Itgb4A2A863 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Itgb4A2A863 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Itgb4A2A863 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Itgb4A2A863 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Itgb4A2A863 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Itgb4A2A863 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Itgb4A2A863 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Itgb4A2A863 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Itgb4A2A863 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Itgb4A2A863 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Itgb4A2A863 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Itgb4A2A863 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Itgb4A2A863 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Itgb4A2A863 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Itgb4A2A863 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Itgb4A2A863 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Itgb4A2A863 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Itgb4A2A863 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Itgb4A2A863 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Itgb4A2A863 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Itgb4A2A863 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Itgb4A2A863 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Itgb4A2A863 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Itgb4A2A863 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Itgb4A2A863 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Itgb4A2A863 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Itgb4A2A863 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Itgb4A2A863 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Itgb4A2A863 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Itgb4A2A863 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Itgb4A2A863 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Itgb4A2A863 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Itgb4A2A863 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Itgb4A2A863 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Itgb4A2A863 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Itgb4A2A863 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Itgb4A2A863 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Itgb4A2A863 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Itgb4A2A863 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Itgb4A2A863 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Itgb4A2A863 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Itgb4A2A863 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Itgb4A2A863 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Itgb4A2A863 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Itgb4A2A863 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Itgb4A2A863 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Itgb4A2A863 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Itgb4A2A863 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Itgb4A2A863 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms