Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIW3

Frmpd3, FERM and PDZ domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd3A0A140LIW3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Frmpd3A0A140LIW3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Frmpd3A0A140LIW3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Frmpd3A0A140LIW3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Frmpd3A0A140LIW3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Frmpd3A0A140LIW3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Frmpd3A0A140LIW3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Frmpd3A0A140LIW3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Frmpd3A0A140LIW3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Frmpd3A0A140LIW3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Frmpd3A0A140LIW3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Frmpd3A0A140LIW3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Frmpd3A0A140LIW3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Frmpd3A0A140LIW3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Frmpd3A0A140LIW3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Frmpd3A0A140LIW3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Frmpd3A0A140LIW3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Frmpd3A0A140LIW3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Frmpd3A0A140LIW3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Frmpd3A0A140LIW3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Frmpd3A0A140LIW3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Frmpd3A0A140LIW3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Frmpd3A0A140LIW3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Frmpd3A0A140LIW3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Frmpd3A0A140LIW3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Frmpd3A0A140LIW3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Frmpd3A0A140LIW3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Frmpd3A0A140LIW3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Frmpd3A0A140LIW3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Frmpd3A0A140LIW3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Frmpd3A0A140LIW3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Frmpd3A0A140LIW3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Frmpd3A0A140LIW3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Frmpd3A0A140LIW3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Frmpd3A0A140LIW3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Frmpd3A0A140LIW3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Frmpd3A0A140LIW3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Frmpd3A0A140LIW3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Frmpd3A0A140LIW3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Frmpd3A0A140LIW3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Frmpd3A0A140LIW3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Frmpd3A0A140LIW3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Frmpd3A0A140LIW3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Frmpd3A0A140LIW3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Frmpd3A0A140LIW3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Frmpd3A0A140LIW3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Frmpd3A0A140LIW3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Frmpd3A0A140LIW3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Frmpd3A0A140LIW3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Frmpd3A0A140LIW3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Frmpd3A0A140LIW3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Frmpd3A0A140LIW3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Frmpd3A0A140LIW3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Frmpd3A0A140LIW3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Frmpd3A0A140LIW3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Frmpd3A0A140LIW3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Frmpd3A0A140LIW3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Frmpd3A0A140LIW3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Frmpd3A0A140LIW3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Frmpd3A0A140LIW3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Frmpd3A0A140LIW3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Frmpd3A0A140LIW3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Frmpd3A0A140LIW3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Frmpd3A0A140LIW3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Frmpd3A0A140LIW3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Frmpd3A0A140LIW3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Frmpd3A0A140LIW3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Frmpd3A0A140LIW3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Frmpd3A0A140LIW3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Frmpd3A0A140LIW3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Frmpd3A0A140LIW3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Frmpd3A0A140LIW3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Frmpd3A0A140LIW3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Frmpd3A0A140LIW3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Frmpd3A0A140LIW3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Frmpd3A0A140LIW3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Frmpd3A0A140LIW3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Frmpd3A0A140LIW3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Frmpd3A0A140LIW3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Frmpd3A0A140LIW3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Frmpd3A0A140LIW3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Frmpd3A0A140LIW3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Frmpd3A0A140LIW3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Frmpd3A0A140LIW3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Frmpd3A0A140LIW3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Frmpd3A0A140LIW3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Frmpd3A0A140LIW3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Frmpd3A0A140LIW3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Frmpd3A0A140LIW3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Frmpd3A0A140LIW3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Frmpd3A0A140LIW3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Frmpd3A0A140LIW3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Frmpd3A0A140LIW3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Frmpd3A0A140LIW3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Frmpd3A0A140LIW3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Frmpd3A0A140LIW3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms