Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933424G06RikA0A140LIP3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
4933424G06RikA0A140LIP3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933424G06RikA0A140LIP3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933424G06RikA0A140LIP3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933424G06RikA0A140LIP3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933424G06RikA0A140LIP3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933424G06RikA0A140LIP3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
4933424G06RikA0A140LIP3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933424G06RikA0A140LIP3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933424G06RikA0A140LIP3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933424G06RikA0A140LIP3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4933424G06RikA0A140LIP3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
4933424G06RikA0A140LIP3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
4933424G06RikA0A140LIP3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
4933424G06RikA0A140LIP3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
4933424G06RikA0A140LIP3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
4933424G06RikA0A140LIP3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933424G06RikA0A140LIP3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933424G06RikA0A140LIP3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4933424G06RikA0A140LIP3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933424G06RikA0A140LIP3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms