Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trbv2A0A0B4J1G8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trbv2A0A0B4J1G8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trbv2A0A0B4J1G8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms