Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif3aP28741 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms