Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhoP15409 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RhoP15409 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RhoP15409 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RhoP15409 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
RhoP15409 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RhoP15409 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhoP15409 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhoP15409 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhoP15409 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhoP15409 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhoP15409 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhoP15409 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhoP15409 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhoP15409 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhoP15409 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhoP15409 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhoP15409 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RhoP15409 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhoP15409 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RhoP15409 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhoP15409 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhoP15409 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhoP15409 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RhoP15409 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhoP15409 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhoP15409 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhoP15409 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RhoP15409 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhoP15409 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhoP15409 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhoP15409 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhoP15409 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhoP15409 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhoP15409 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhoP15409 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RhoP15409 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhoP15409 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhoP15409 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhoP15409 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhoP15409 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhoP15409 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhoP15409 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhoP15409 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhoP15409 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhoP15409 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhoP15409 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhoP15409 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhoP15409 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhoP15409 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhoP15409 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhoP15409 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhoP15409 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhoP15409 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RhoP15409 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RhoP15409 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhoP15409 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhoP15409 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhoP15409 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhoP15409 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhoP15409 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhoP15409 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhoP15409 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhoP15409 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhoP15409 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhoP15409 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhoP15409 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhoP15409 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RhoP15409 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RhoP15409 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RhoP15409 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms