Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5C7

Znf728, Zinc finger protein 728, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf728Q6P5C7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf728Q6P5C7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms