Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kif3aP28741 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kif3aP28741 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms