Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb3P09026 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms