Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnga1P29974 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnga1P29974 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cnga1P29974 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnga1P29974 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnga1P29974 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnga1P29974 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnga1P29974 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnga1P29974 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnga1P29974 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnga1P29974 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnga1P29974 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnga1P29974 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnga1P29974 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnga1P29974 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnga1P29974 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga1P29974 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms