Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb3P09026 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms